Les bactéries résistantes aux antibiotiques et d’autres microbes constituent une menace grave et croissante pour la santé publique. Des données publiées aujourd’hui par les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) quantifient le coût annuel de ces super‑pathogènes, et la situation est loin d’être rassurante.
Le mardi, le CDC a publié la dernière version de son Rapport sur les menaces liées à la résistance antimicrobienne (AR). L’agence estime qu’environ 10 millions d’infections et plus de 50 000 décès survenus aux États‑Unis annuellement sont désormais causés par des bactéries et des champignons résistant aux antimicrobiens — des estimations bien supérieures à celles publiées en 2019. Bien que certains progrès aient été accomplis pour limiter certaines infections résistantes, les experts externes avertissent qu’il faut bien davantage de progrès pour prévenir l’imminence d’une apocalypse antimicrobienne.
« Ces chiffres sont alarmants à bien des égards mais prennent une dimension particulièrement lourde lorsque les médecins spécialistes des maladies infectieuses relient ces statistiques à des patients réels dans leur pratique quotidienne », a déclaré Wendy Armstrong, clinicienne et présidente de l’Infectious Diseases Society of America, dans une déclaration fournie à Gizmodo.
Un bilan qui s’alourdit
La CDC a publié sa première édition du Rapport sur les Menaces liées à la Résistance Antimicrobienne en 2013. En 2019, elle a publié un dénombrement plus exhaustif axé sur 18 microbes résistants aux antibiotiques jugés particulièrement urgents ou graves, y compris le champignon émergent Candida auris (depuis renommé Candidozyma auris). Ce rapport estimait qu’environ 2,8 millions d’infections et 35 000 décès annuels étaient causés par des germes résistants. En 2024, le CDC a publié un autre rapport qui mettait en lumière les germes résistants courants dans les établissements de soins de santé, mais ce nouveau rapport demeure le plus complet publié depuis 2019.
En s’appuyant sur les données de 2023, les bactéries et les champignons résistants aux antimicrobiens représentent désormais environ 9,7 millions d’infections et 50 800 décès aux États‑Unis chaque année, selon le CDC. Environ 40 000 de ces décès sont liés à des infections associées aux soins de santé; ces infections ont également entraîné près de 12 milliards de dollars de coûts liés aux soins de santé.
La liste des germes « super » les plus préoccupants s’élève désormais à 19, répartis en quatre menaces urgentes, treize menaces sérieuses et deux menaces préoccupantes; six autres germes figurent sur une liste de surveillance. La dernière addition est Neisseria meningitidis résistante aux antibiotiques, classée comme une menace sérieuse.
Il existe toutefois des signes encourageants. Les taux d’infections causées par Clostridioides difficile, une source commune d’infections liées à l’hôpital, ont commencé à diminuer en 2018 et sont restés stables depuis 2020. À ce titre, la maladie bactérienne a été rétrogradée d’une menace urgente à une menace sérieuse. Cela suggère que les politiques visant à réduire les infections et la propagation de la résistance dans les hôpitaux fonctionnent dans une certaine mesure.
En parallèle, les infections causées par C. auris, bien que globalement rares, ont été multipliées par dix depuis 2019, et certaines souches ont montré une résistance à pratiquement tous les antifongiques disponibles. Le rapport souligne également que certains gènes conférant une résistance aux antibiotiques les plus précieux se propagent largement entre les bactéries.
« Il m’arrive fréquemment de voir un patient chez qui se présente un agent pathogène, puis nous recevons le bulletin de sensibilité du laboratoire. Et tout le panel sera résistant, sans qu’aucun médicament identifié ne puisse réellement traiter efficacement leur agent pathogène », a déclaré Armstrong, qui est également responsable de la Division des Maladies Infectieuses à l’École de médecine de l’Université du Colorado, au Gizmodo par téléphone. « Et c’est honnêtement terrifiant. »
Ce qui doit être fait
Les scientifiques travaillent sur des stratégies novatrices pour s’attaquer à certains de ces superpathogènes avant qu’ils ne posent problème, notamment des vaccins contre les infections résistantes comme la gonorrhée, les diarrhées causées par Shigella et C. auris. Mais nous aurons toujours besoin d’un approvisionnement constant en antimicrobiens pour faire face à ces infections en constante évolution. Malheureusement, le tuyau d’approvisionnement en antibiotiques et antifongiques ne cesse de se vider au fil des années.
Cette pénurie est aggravée par le fait que les antimicrobiens nouvellement développés doivent être utilisés aussi parcimonieusement que possible afin de préserver leur efficacité. Cette rareté signifie que les sociétés pharmaceutiques ne peuvent généralement pas en tirer le même profit qu’avec d’autres médicaments, et de nombreuses entreprises ont tout simplement abandonné le domaine, invoquant les coûts élevés de recherche et développement.
Plusieurs organisations et pays ont tenté de motiver les grandes entreprises pharmaceutiques à revenir vers le développement antimicrobien de différentes manières. Une idée de plus en plus populaire prévoit un modèle de type « abonnement Netflix », où les gouvernements négocient un paiement forfaitaire constant pour le médicament d’une société, quelle que soit son utilisation réelle. Cette stratégie, et d’autres, font partie de la Pasteur Act, une loi bipartisane destinée à accélérer davantage le processus de mise sur le marché de nouveaux médicaments aux États‑Unis. L’IDSA et d’autres organisations font pression pour son adoption.
« La Pasteur Act est un moyen de réaligner les incentives en faveur du développement d’antibiotiques innovants d’une importance notable pour la santé publique, en particulier pour ces organismes résistants », a déclaré Armstrong. « Nous avons vu des lieux où ce modèle fonctionne, et nous avons constaté que ce que nous faisons aujourd’hui ne fonctionne pas du tout. »
Sans progrès réels, les infections résistantes menacent de causer beaucoup plus de dégâts et de décès dans un avenir proche. Selon un rapport du gouvernement britannique de 2014, ces infections pourraient causer 10 millions de décès dans le monde chaque année d’ici 2050, ce qui frapperait presque le même chiffre de décès que le cancer aujourd’hui.
Plus encore, ce type d’infections affecterait notre santé encore davantage que ce qu’elle ne l’est aujourd’hui. Tout, des grossesses à la chimiothérapie, en passant par les opérations chirurgicales courantes, repose sur le filet de sécurité que constituent les antimicrobiens. Sans ce filet, le monde deviendra un endroit plus dangereux, bien plus que ce qu’il était avant l’ère des antibiotiques.
L’article a été mis à jour avec des commentaires supplémentaires de Wendy Armstrong.
