Un champignon pathogène dangereux a appris à déjouer totalement l’humanité — et ce n’est pas la première fois.
Dans un rapport récent, des chercheurs kényans ont décrit un cas inquiétant de Candidozyma auris détecté chez une femme de 28 ans. Selon leurs constatations, l’infection présentait une résistance à toutes les grandes familles d’antifongiques. Cette souche particulière pourrait ne pas être liée aux cas précédents de pan-résistance, affirment les chercheurs, laissant penser que ce champignon peut à répétition s’adapter à l’ensemble des traitements dont nous disposons.
La résistance de la souche à quatre grandes classes d’antifongiques met en évidence la menace croissante que représentent les infections fongiques incurables, particulièrement dans les milieux où l’accès à de nouveaux antifongiques est limité, écrivent les auteurs dans leur étude publiée fin du mois dernier dans la revue Scientific Reports.
A pan-resistant threat
C. auris (anciennement connu sous le nom de Candida auris) s’est imposé comme l’une des menaces les plus préoccupantes parmi les superpathogènes fongiques au niveau mondial. Bien que de nombreuses personnes portent ce champignon sur leur peau sans en subir de dommages, il peut provoquer des infections graves et potentiellement mortelles chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli ou en mauvaise santé générale. Ce qui rend C. auris particulièrement inquiétant, c’est qu’il est particulièrement habile à évoluer pour résister aux traitements antifongiques les plus courants utilisés contre les infections fongiques.
Ce dernier cas a été documenté chez une femme qui s’était rendue dans un hôpital pour une chirurgie ambulatoire. Après l’intervention, elle a développé une infection associée à l’hôpital au niveau du site opératoire. Bien qu’on lui ait administré des antibiotiques en raison d’une suspicion d’infection bactérienne, son état s’est aggravé et un prélèvement du pus de sa plaie a révélé la présence de C. auris. Les chercheurs ont finalement confirmé que sa souche résistait à toutes les quatre grandes classes d’antifongiques. Selon le rapport, l’hôpital a été informé de cette résistance afin de faciliter la mise en œuvre de mesures de prévention et de contrôle des infections spécifiques à C. auris. Toutefois, le rapport ne précise pas ce qui est advenu de la patiente elle-même.
Au fil des années, il y a eu plusieurs flambées et cas de C. auris fortement résistants, et au moins un cas confirmé d’infection résistante à toutes les quatre grandes familles d’antifongiques a été signalé en 2022. Si cela serait alors seulement le deuxième cas de pan-résistance documenté dans le monde, les chercheurs estiment qu’il existe une complication supplémentaire qui rend cette découverte d’autant plus inquiétante.
Les chercheurs ont séquencé le génome de la souche de la patiente et ont découvert qu’elle porte des mutations de résistance différentes de celles observées dans le cas de 2022. Bien que les chercheurs ne puissent pas exclure totalement la possibilité que ce cas provienne de la souche antérieure, ils estiment qu’il est plus probable que cette lignée de C. auris ait développé la pan-résistance de manière indépendante.
A worrying superbug future
C. auris demeure une infection fongique relativement rare, mais sa charge mondiale a clairement augmenté au fil du temps. On a signalé au moins 6 304 cas aux États‑Unis en 2024, chiffre le plus élevé à ce jour, et elle a été documentée dans au moins 50 pays.
Pour l’instant, les infections totalement incurables de C. auris restent probablement rares. Les flambées de C. auris peuvent également être maîtrisées grâce à des mesures de confinement et de prévention adéquates, en dehors des antifongiques. Et les scientifiques travaillent à développer d’autres types d’interventions, comme des vaccins contre le champignon. Mais si la pan-résistance devient une réalité fréquente, il existe toujours le risque que l’une de ces souches finisse par se propager largement et rendre C. auris encore plus difficile à gérer.